Bei den ÖBB spricht man von einem notwendigen „Service“, das mit jenem bei Autos vergleichbar sei. So werden etwa Weichen erneuert und Oberleitungen ausgetauscht. In St. Andrä-Wördern (Bezirk Tulln) wird zudem derzeit der Bahnhof umgebaut.
Änderungen von 22. bis 23. und 27. bis 30. Oktober
Die Bauarbeiten auf der Franz-Josefs-Bahn finden in mehreren Phasen statt: Diese Woche kommt es von Donnerstag bis Freitag, in der kommenden Woche von Dienstag bis Freitag (27. bis 30. Oktober) zu Einschränkungen zwischen Wien und St. Andrä-Wördern. An diesen Tagen fallen die S-Bahn-Züge vom Wiener Franz-Josefs-Bahnhof mit den Zielen Kritzendorf (Bezirk Tulln) bzw. St. Andrä-Wördern und retour aus. Zwischen Kritzendorf bzw. St. Andrä-Wördern und Wien Heiligenstadt richten die ÖBB einen Schienenersatzverkehr ein. Die Züge nach Tulln und darüber hinaus fahren an diesen Tagen hingegen planmäßig.
Änderungen von 24. bis 27. Oktober
Weitere Einschränkungen gibt es im Zeitraum zwischen diesen Phasen – konkret am langen Wochenende von Samstag 24. Oktober bis Dienstag 27. Oktober. An diesen Tagen fallen alle Züge zwischen dem Franz-Josefs-Bahnhof und Tulln bzw. Tulln/Stadt und Absdorf-Hippersdorf (Bezirk Tulln) aus. Von Absdorf-Hippersdorf über Tulln bis Wien Heiligenstadt wird es einen Schienenersatzverkehr geben.
Auch die S-Bahn-Züge zwischen Stockerau und Absdorf-Hippersdorf werden in diesem Zeitraum gestrichen. Stattdessen werden die Züge von und nach Krems auf diese Strecke umgeleitet und über Stockerau bis Wien Floridsdorf geführt. Sie halten deshalb laut ÖBB neben Absdorf-Hippersdorf auch in Gaisruck, Hausleiten und Stockerau (alle Bezirk Korneuburg). Die Züge von und nach Ceske Velenice, Gmünd und Sigmundsherberg (Bezirk Horn) werden ab Absdorf-Hippersdorf über Stockerau zum Wiener Praterstern umgeleitet. Die Schnellbahnen zwischen Absdorf-Hippersdorf und Tullnerfeld fahren hingegen planmäßig.
Im Wiener Stadtgebiet kommt es zu etlichen Änderungen der einzelnen Zielbahnhöfe. Fahrgäste der ÖBB können die U-Bahn-Linie U4 zwischen den Stationen Friedensbrücke und Heiligenstadt, die Straßenbahn-Linie D vom Franz-Josefs-Bahnhof nach Nußdorf sowie parallel verlaufende Buslinien ohne Zusatzkosten nutzen.